MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FTNF002-00 chromosome

Total Repeats: 11427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009749	TTA	2	6	3945	3950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009749	TAG	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009749	GGT	2	6	4053	4058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009749	TAC	2	6	4072	4077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009749	TGA	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009749	GAT	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009749	TTA	2	6	4210	4215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009749	CAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009749	GT	3	6	4252	4257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009749	TGA	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009749	ATT	2	6	4307	4312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009749	TGTT	2	8	4324	4331	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009749	GGTA	2	8	4334	4341	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009749	AT	3	6	4373	4378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009749	AAT	2	6	4388	4393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009749	GGT	2	6	4518	4523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009749	T	6	6	4576	4581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009749	TA	3	6	4590	4595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009749	TAG	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009749	ATT	2	6	4704	4709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009749	GAA	2	6	4710	4715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009749	TA	4	8	4758	4765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009749	CT	3	6	4779	4784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009749	T	6	6	4788	4793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009749	TTC	2	6	4809	4814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009749	ATC	2	6	4893	4898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009749	CAT	2	6	4946	4951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009749	ATA	2	6	4966	4971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009749	ATTT	2	8	4974	4981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009749	TGG	2	6	5020	5025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009749	GCA	2	6	5086	5091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009749	TTGA	2	8	5124	5131	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009749	ACA	2	6	5194	5199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009749	TA	3	6	5237	5242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009749	TTTC	2	8	5261	5268	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009749	TAG	2	6	5273	5278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009749	TAA	2	6	5337	5342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009749	AGT	2	6	5350	5355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009749	TTTA	2	8	5424	5431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009749	ATT	2	6	5439	5444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009749	ATTA	2	8	5490	5497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009749	CAG	2	6	5522	5527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009749	ATA	2	6	5540	5545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009749	ATA	2	6	5608	5613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009749	CAA	2	6	5696	5701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009749	T	6	6	5703	5708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009749	ATC	2	6	5790	5795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009749	TA	3	6	5844	5849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009749	ATG	2	6	5991	5996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009749	TCT	2	6	6005	6010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009749	ACA	2	6	6052	6057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009749	AGT	2	6	6117	6122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009749	CAG	2	6	6161	6166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009749	TAGC	2	8	6169	6176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009749	TAC	2	6	6195	6200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009749	TTA	2	6	6217	6222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009749	AT	3	6	6307	6312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009749	TAG	2	6	6322	6327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009749	TA	3	6	6362	6367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009749	T	6	6	6368	6373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009749	ATTA	2	8	6419	6426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009749	TAA	2	6	6454	6459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009749	TGG	2	6	6467	6472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009749	AAG	2	6	6475	6480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009749	T	6	6	6505	6510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009749	CAC	2	6	6519	6524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_009749	AAT	2	6	6541	6546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009749	TTC	2	6	6547	6552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009749	ATGA	2	8	6570	6577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009749	T	6	6	6850	6855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009749	TTG	2	6	6873	6878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009749	AAT	2	6	7854	7859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009749	GAT	2	6	7860	7865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009749	ATA	2	6	8469	8474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009749	T	7	7	8483	8489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009749	A	6	6	8492	8497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009749	AGC	2	6	8519	8524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009749	T	8	8	8525	8532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009749	ATTA	2	8	8572	8579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009749	T	6	6	11104	11109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009749	A	7	7	11112	11118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009749	ATTT	2	8	11127	11134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009749	TAG	2	6	11177	11182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009749	ATA	2	6	11189	11194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009749	T	6	6	11683	11688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009749	ATA	2	6	11692	11697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009749	TCT	2	6	11732	11737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009749	ATT	2	6	11740	11745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009749	ATA	2	6	11748	11753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009749	T	6	6	11773	11778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009749	TAA	2	6	15068	15073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009749	TAA	2	6	15088	15093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009749	TGC	2	6	15245	15250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009749	TGA	2	6	15302	15307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009749	ATT	2	6	15467	15472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009749	GCA	2	6	15490	15495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009749	GAT	2	6	15523	15528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009749	GCT	2	6	15539	15544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009749	CTC	2	6	15594	15599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_009749	AG	3	6	15617	15622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009749	TGA	2	6	15643	15648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009749	CAA	2	6	15767	15772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009749	GCA	2	6	15773	15778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009749	TTA	2	6	16843	16848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009749	ACC	2	6	16928	16933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_009749	TA	3	6	16953	16958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009749	T	6	6	16990	16995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009749	AAT	2	6	17034	17039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009749	TGA	2	6	17056	17061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009749	TAA	2	6	17082	17087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009749	TAC	2	6	17144	17149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009749	ATT	2	6	17154	17159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009749	TAT	2	6	17240	17245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009749	ATT	2	6	17268	17273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009749	TAT	3	9	17285	17293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009749	TAA	2	6	19135	19140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009749	ATT	2	6	19164	19169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009749	AGA	2	6	19187	19192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009749	TAA	2	6	19207	19212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009749	CAAA	2	8	19218	19225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009749	AGCTA	2	10	19244	19253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009749	TGA	2	6	19260	19265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009749	TAAA	2	8	20473	20480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009749	TTAAT	2	10	20485	20494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009749	TAAC	2	8	20495	20502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009749	CAT	2	6	20548	20553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009749	CT	3	6	20561	20566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009749	ACCA	2	8	20633	20640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009749	TGATT	2	10	20672	20681	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009749	TAT	2	6	20723	20728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009749	AAT	2	6	20775	20780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009749	TTC	2	6	20793	20798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009749	TAG	2	6	20837	20842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009749	ACC	2	6	20880	20885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_009749	ATA	2	6	20888	20893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009749	CAT	2	6	20915	20920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009749	CTG	2	6	20945	20950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009749	TTAA	2	8	20956	20963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009749	TAA	2	6	21096	21101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009749	TA	3	6	21986	21991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009749	T	6	6	21994	21999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009749	AT	3	6	22010	22015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009749	A	6	6	22016	22021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009749	A	7	7	22029	22035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009749	TAA	2	6	22086	22091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009749	ATT	2	6	22168	22173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009749	AGTT	2	8	22193	22200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009749	ATA	2	6	22388	22393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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